Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FOXF2Q12947 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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FOXF2Q12947 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FOXF2Q12947 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FOXF2Q12947 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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