Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMA1Q12791 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms