Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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