Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EP300Q09472 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EP300Q09472 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EP300Q09472 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EP300Q09472 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EP300Q09472 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EP300Q09472 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EP300Q09472 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EP300Q09472 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EP300Q09472 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EP300Q09472 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EP300Q09472 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms