Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms