Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNDQ07001 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms