Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBQ06643 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBQ06643 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBQ06643 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBQ06643 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms