Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTPN11Q06124 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms