Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALD1Q05682 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALD1Q05682 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms