Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN12Q05209 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms