Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF17Q02223 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms