Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN7AQ01118 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms