Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK6Q00534 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms