Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXC5Q00444 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXC5Q00444 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms