Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD3P84022 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms