Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP1P63208 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP1P63208 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP1P63208 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP1P63208 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SKP1P63208 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SKP1P63208 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP1P63208 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP1P63208 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms