Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VBP1P61758 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms