Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RND3P61587 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RND3P61587 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RND3P61587 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RND3P61587 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RND3P61587 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RND3P61587 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RND3P61587 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RND3P61587 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RND3P61587 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RND3P61587 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RND3P61587 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RND3P61587 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RND3P61587 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RND3P61587 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms