Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DEFA3P59666 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DEFA3P59666 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms