Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP107P57740 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP107P57740 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms