Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HDAC4P56524 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC4P56524 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms