Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ELLP55199 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ELLP55199 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELLP55199 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms