Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AQP4P55087 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AQP4P55087 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AQP4P55087 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AQP4P55087 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AQP4P55087 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AQP4P55087 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AQP4P55087 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AQP4P55087 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms