Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOSBP53539 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOSBP53539 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOSBP53539 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOSBP53539 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FOSBP53539 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOSBP53539 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOSBP53539 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOSBP53539 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOSBP53539 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms