Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP153P49790 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP153P49790 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP153P49790 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP153P49790 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP153P49790 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP153P49790 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP153P49790 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP153P49790 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP153P49790 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP153P49790 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP153P49790 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP153P49790 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP153P49790 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP153P49790 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP153P49790 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP153P49790 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP153P49790 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP153P49790 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms