Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CLK1P49759 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLK1P49759 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLK1P49759 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLK1P49759 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLK1P49759 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLK1P49759 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLK1P49759 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms