Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRPC1P48995 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRPC1P48995 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms