Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NESP48681 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NESP48681 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NESP48681 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NESP48681 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NESP48681 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NESP48681 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NESP48681 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NESP48681 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NESP48681 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NESP48681 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NESP48681 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NESP48681 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NESP48681 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
NESP48681 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NESP48681 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NESP48681 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NESP48681 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NESP48681 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NESP48681 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NESP48681 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NESP48681 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NESP48681 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NESP48681 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NESP48681 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NESP48681 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NESP48681 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NESP48681 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NESP48681 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NESP48681 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
NESP48681 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NESP48681 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NESP48681 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NESP48681 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NESP48681 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NESP48681 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NESP48681 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NESP48681 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NESP48681 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NESP48681 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NESP48681 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NESP48681 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NESP48681 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NESP48681 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NESP48681 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NESP48681 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NESP48681 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NESP48681 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NESP48681 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NESP48681 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NESP48681 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NESP48681 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NESP48681 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NESP48681 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NESP48681 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NESP48681 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NESP48681 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NESP48681 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NESP48681 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NESP48681 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NESP48681 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NESP48681 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NESP48681 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NESP48681 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NESP48681 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NESP48681 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NESP48681 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NESP48681 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NESP48681 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NESP48681 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
NESP48681 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NESP48681 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
NESP48681 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NESP48681 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NESP48681 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NESP48681 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NESP48681 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NESP48681 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NESP48681 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NESP48681 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NESP48681 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NESP48681 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NESP48681 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NESP48681 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NESP48681 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NESP48681 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms