Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ME1P48163 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ME1P48163 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ME1P48163 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ME1P48163 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ME1P48163 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ME1P48163 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms