Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP5P45974 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP5P45974 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP5P45974 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP5P45974 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP5P45974 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms