Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV4P43268 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV4P43268 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV4P43268 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV4P43268 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV4P43268 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV4P43268 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV4P43268 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV4P43268 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV4P43268 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms