Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF5P43026 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF5P43026 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDF5P43026 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDF5P43026 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF5P43026 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GDF5P43026 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms