Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NSG1P42857 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSG1P42857 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSG1P42857 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSG1P42857 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSG1P42857 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSG1P42857 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSG1P42857 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NSG1P42857 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NSG1P42857 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NSG1P42857 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms