Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms