Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP62P37198 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP62P37198 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP62P37198 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP62P37198 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP62P37198 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP62P37198 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP62P37198 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP62P37198 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP62P37198 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP62P37198 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP62P37198 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP62P37198 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NUP62P37198 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP62P37198 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms