Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYKP34925 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYKP34925 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYKP34925 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYKP34925 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms