Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFNP31947 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFNP31947 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFNP31947 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFNP31947 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFNP31947 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFNP31947 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFNP31947 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFNP31947 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFNP31947 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFNP31947 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms