Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CPS1P31327 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CPS1P31327 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPS1P31327 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CPS1P31327 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPS1P31327 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPS1P31327 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPS1P31327 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms