Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 SMIM30-201ENST00000397764 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 PPP1R2P1-210ENST00000429032 618 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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HOXD11P31277 AC109587.1-213ENST00000610844 652 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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HOXD11P31277 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 DUSP19-201ENST00000342619 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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HOXD11P31277 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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HOXD11P31277 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC022558.3-201ENST00000616598 688 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 ZNF738-202ENST00000380870 1142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD11P31277 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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