Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC27P30260 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC27P30260 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC27P30260 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC27P30260 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC27P30260 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC27P30260 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC27P30260 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC27P30260 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC27P30260 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC27P30260 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms