Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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