Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARID4AP29374 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms