Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO1P25800 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMO1P25800 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMO1P25800 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LMO1P25800 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms