Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MYF6P23409 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYF6P23409 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms