Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
S100A1P23297 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
S100A1P23297 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A1P23297 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms