Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KCNA6P17658 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNA6P17658 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms