Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA1P14867 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms