Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXB3P14651 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms