Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms