Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP4P12644 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP4P12644 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP4P12644 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP4P12644 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP4P12644 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP4P12644 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP4P12644 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP4P12644 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP4P12644 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms